Ai es una joven estudiante de secundaria, pero a sus 14 años de edad, ahora permanece en casa. Y que recientemente, su mejor amiga Koito, se ha quitado la vida sin aparente razón.
En general, Ai no ha disfrutado mucho su vida, y es que, al padecer heterocromía, suele ser el objeto de burlas y abusos de otros.
Por ello, el que haya sido capaz de hacer una amiga, y que ésta la dejara de forma tan abrupta, ha cambiado su vida por completo.
Una noche, sale de su casa y se va a jugar, ahí escucha una misteriosa voz que la guía hasta una máquina de la cual puede obtener un “Wonder Egg”. Al regresar a casa, se queda dormida y siente que es transportada a otro mundo.
Ahí, es acorralada y obligada a romper el huevo que tiene en su posesión. Para su sorpresa, aparece otra chica de su edad, quien de inmediato le dice que deben huir del lugar.
No pasa mucho tiempo, antes de que una horda de monstruos comience a perseguirlas y atacarlas, en la confusión, Ai ve que los ataques de las criaturas no le hacen daño, pero sí a la chica que apareció al romper el huevo.
Los ataques son despiadados, pero si las chicas sobreviven el resto del día, Ai podría hacer algo para que su amiga Koito regrese.
Animada, Ai decide que tendrá que buscar más huevos y proteger a quienes salgan de ellos, todo con tal de volver a ver a su amiga y comprender porque se quitó la vida en la escuela.
Al hacerlo, conocerá a otras jóvenes con serios problemas emocionales.
(ワンダーエッグ・プライオリティ)
