Rentarou es un chico de buenos sentimientos, pero que se ha comportado de manera precoz desde su infancia. Y es que por alguna razón, anhela con todo su corazón tener una novia.
El día de hoy, termina la escuela secundaria, y no duda en declararle sus sentimientos a una compañera de clase, todo para ser rechazado por la centésima ocasión.
Rentarou le cuenta su triste historia a su mejor amigo, quien no puede creer que haya sobrevivido tantos rechazos a tan corta edad.
Rentarou decide ir al templo a pedir por una mejor fortuna al entrar a la escuela preparatoria. Y para su sorpresa, mientras reza, un dios aparece frente a él y lo sorprende.
El dios le dice que todos tenemos un alma gemela en el mundo, y le asegura que en la preparatoria conocerá a la suya, y la reconocerá porque sentirá un choque eléctrico en su cuerpo. Mientras le da más detalles, le avisa que él tendrá 100 en los próximos tres años.
Rentarou no puede creerlo, pero el dios le dice que debido a un error que cometió en su trabajo, terminó escribiendo esa cantidad en una de sus formas de trabajo.
Luego de unas semanas, comienzan las clases en la nueva escuela de Rentarou, y está decidido a disfrutarlo. De inmediato, se topa con dos chicas, Hakari y Karane.
De inmediato, los tres sienten un choque eléctrico, Rentarou sabe lo que significa, pero no las chicas. Él se acerca a ayudarlas a incorporarse, y cuando Hakari observa a Karane, entiende que ella también sintió algo especial por Rentarou.
Hakari finge estar lastimada y le pide a Rentarou que la acompañe a la enfermería, y al escucharla, Karane también se queja, pero no acepta en un principio la ayuda del joven.
Al final, Rentarou termina abrazado por las dos chicas, y en el camino escuchan una leyenda de la escuela, que indica que quien encuentre un trébol especial podría tener una relación especial con la persona a la que le sea entregado.
Horas después, Rentarou observa a Hakari y Karane buscando el trébol, y entiende que lo hacen por él.
Al acercarse, Rentarou comparte una bebida con Hakari mientras Karane se pone celosa. En ese instante, las dos le declaran su amor y él no sabe como contestarles, después de todo, siempre ha sido él el rechazado y entiende lo que se siente.
Rentarou decide ir al templo a rezar, y nuevamente aparece el dios para darle una mala noticia. Si no trata bien a sus almas gemelas, y las rechaza, perderán su vida.
Con esta noticia, Rentarou comprende que debe tratar la situación con cuidado. Y después de considerar todas sus opciones, recurre a la leyenda del trébol y pasa toda la noche buscando dos.
De alguna forma, convence a Hakari y Karane, y Rentarou tiene dos novias, y le faltan 98.
(君のことが大大大大大好きな100人の彼女)
