Souta Harate tiene una habilidad sin igual, es capaz de ver las emociones de las personas en forma de una bandera sobre ellos. Después de varias experiencias, sabe que se trata de un momento importante en la vida de la persona. Pero él no es feliz, y suele estar deprimido y solitario.
Se transfiere a la academia Hatagaya, y el primer día se topa con problemas, aunque es capaz de salvar la vida de Nanami, una princesa de una tierra lejana.
Ambos terminan como compañeros en la misma clase, y por alguna razón, ella es capaz de reconocer que algo inusual pasa con Souta. Ella es lo suficientemente curiosa para preguntarle qué le pasa, él le comenta su pesar, y sorprendentemente, ella le cree. Él está sorprendido, e incluso es incapaz de ver una bandera sobre ella.
Más tarde, Akane, heredera de una reconocida familia, se presenta ante él. Souta también se siente atraído por ella, pero para Akane, Souta es como un perrito sin hogar, en busca de ayuda.
Él prefiere mantenerse alejado de las personas, ya que considera que atrae la mala fortuna. Sin embargo, ambas jóvenes deciden estar junto a él. Incluso le visitan en el dormitorio donde vivirá, un edificio viejo y abandonado, es más, a punto de desplomarse.
Al conocerse, se desarrollará una historia más compleja, incluso la vida de Akane no es lo que uno esperaría. En un punto, Souta ve una bandera que indica la muerte de su compañera, por lo que decide rescatarla.
Después de tales sucesos, ambas chicas deciden vivir en el dormitorio junto a Souta, y le dicen que puede hacer mucho más en la vida, además derenunciar. Así, el viejo edificio es remodelado, y Souta deberá estar preparado para recibir a nuevos inquilinos, todos parte de un secreto del pasado, que determinará el futuro.
(彼女がフラグをおられたら)