Nariyuki es un estudiante de secundaria en la Academia Ichinose, ha trabajado duro para convertirse en un buen estudiante y ha puesto sus ojos en una prestigiosa beca universitaria.
Un día, consciente de la meta de Nariyuki, el director le ordena que sea tutor de un par de estudiantes, de otra forma, no podrá ganar la recomendación para obtener la beca, así que deberá ayudarlas a alcanzar sus objetivos.
Ambas estudiantes son reconocidas como unas prodigios, Fumino es un genio de la literatura y Rizu es impecable en matemáticas y ciencias; sin embargo, se niegan a estudiar una carrera afín a esos temas. Por el contrario, Fumino quiere convertirse en astrónoma, y necesita sobresalir en matemáticas y es pésima. Y Rizu pretende estudiar psicología, pero carece de habilidades de comunicación.
Tan pronto como Nariyuki conoce a las chicas, se da cuenta de que ser un genio en un tema no es suficiente para lograr forjar un camino en la vida. Una cosa está clara de inmediato, Fumino y Rizu son incapaces de enseñar lo que entienden de forma natural.
A medida que pasan los días, Nariyuki intenta poner a prueba sus conocimientos y no puede entender el porqué no pueden aprender. Ambas chicas están frustradas y piensan que Nariyuki se negará a ser su tutor, después de todo, muchos otros maestros ya las han abandonado antes.
Pero en cambio, Nariyuki decide ayudarlas, después de todo, él también tiene un sueño que cumplir. Y apenas comienza a relacionarse con ellos, comprende que tienen un proceso de razonamiento diferente.
Tan pronto como muestra algunos resultados, el director de la Academia decide que puede ayudar a otra estudiante problemática llamado Uruka, una prodigio de la natación, con el objetivo de competir con los mejores, pero que es una estudiante muy perezosa.
De hecho, Nariyuki la conoce bien y la ha ayudado múltiples veces desde la secundaria. Ahora, el joven tiene su mente y tiempo completamente consumidos por estas tres chicas, y de alguna manera, tiene que mantenerse enfocado en la escuela y nada más.
(ぼくたちは勉強ができない)