Después de décadas de guerra, las naciones del mundo han entrado en una etapa de paz, sin embargo, las tensiones entre estas no ha cesado.
Y luego de algunos años, distintos grupos de espías han sido conformados para mantener el control de la información. Klaus es uno de ellos, y se le considera uno de los mejores, pero ha llegado el momento que lo demuestre con una misión imposible.
Su superior le dice que si logra su objetivo, nada ni nadie dudará que él es el mejor espía de la historia. Y Klaus parece estar muy motivado por sus palabras.
Mientras tanto, en una de las distintas academias de espías, Lily recibe órdenes para incorporarse de inmediato a un nuevo grupo de espías.
Luego de viajar, Lily se encuentra con su nuevo equipo, y de inmediato queda claro que todas las integrantes son consideradas casos especiales en sus respectivas academias.
Klaus aparece y se presenta como su nuevo instructor, y les dice que serán preparadas para enfrentar misiones imposibles, las cuales suelen tener solo un 10 por ciento de probabilidad de éxito.
De inmediato, las chicas comienzan a especular que si se piensa, todas son piezas intercambiables para el sistema, y que si mueren, es muy probable que solo Klaus sobreviva y termine la misión con éxito.
Al día siguiente, Klaus intenta impartirles una clase para demostrar las habilidades que requieren para la misión, y en un instante abre una serie de candados, pero cuando Lily y el resto de las espías le piden más información, él es incapaz de enseñarles un método claro.
Más tarde, Lily recuerda el porqué anheló convertirse en una espía, y entiende que si todo sigue así, no vivirá para ayudar a quien más lo necesite.
Decide acercarse a Klaus y sugerirle que hagan algún tipo de actividad para integrar al equipo. Y le ofrece una serie de actividades en el pueblo, pero a la mañana siguiente, solo Lily y él se presentan.
Durante el día, Klaus demuestra que sus habilidades como espía son espontáneas, y ambos entienden que no podrá enseñarle nada a sus nuevas estudiantes.
Al acudir a un lago, ambos deciden subir a un bote, y después de unos minutos Lily ataca a Klaus con un veneno paralizante. En ese momento, Lily le dice que no quiere morir en vano, y que debe desistir, si lo que desea es usarlas como escudo humano.
Klaus le dice que esa nunca fue su intención, sino lo contrario, pero que quizá la forma en que les informó sus objetivos fue equivocada.
Lily cree en su palabra, pero cuando Klaus le pide que le suministre el antídoto, ella se da cuenta que no lo trae a la mano, mientras tanto, el bote comienza a hundirse, lo que demuestra que Klaus sabía de antemano el objetivo de Lily, y que le permitió atacarlo a propósito.
Finalmente a salvo, Klaus comprende que debe hacer algo para cambiar el ánimo de su equipo. Nuevamente se presenta ante las espías y les informa que todas deberán esforzarse para sobrevivir, y que no piensa perder a ninguna durante su misión.
(スパイ教室)
